Университет образован в рамках национального проекта “Образование”  распоряжением Правительства Российской Федерации от 23 ноября 2006 г. №1616-р в результате реорганизации в форме присоединения к государственному образовательному учреждению высшего профессионального образования «Ростовский государственный университет» государственных образовательных учреждений высшего профессионального образования «Ростовская государственная академия архитектуры и искусства», «Ростовский государственный педагогический университет», «Таганрогский  государственный радиотехнический университет».

Напомним, что 4 ноября 2006 года был создан Сибирский федеральный университет, а 23 ноября 2006 Южный федеральный. Опыт создания и деятельности СФУ и ЮФУ стал основой  создания сети федеральных университетов.