Размер шрифта

A
A

Межстрочный интервал

A
A

Цвет

A
A

Учёные ЮФУ разработали метод исследования древней ДНК 

23.09.2018

В Южном федеральном университете, в лаборатории идентификации объектов биологического происхождения проводятся уникальные работы по извлечению и расшифровки ДНК из фрагментов костей и других биологических материалов. Руководит лабораторией доктор биологических наук Игорь Корниенко.


- В современной биологии трендом является изучение древней ДНК. За последние 25 лет мы сильно продвинулись в изучении древней ДНК благодаря развитию различных методов исследования. К сожалению, сейчас не все лаборатории имеют возможность работать именно с древней ДНК: сложность заключается в том, что после смерти от человека остаётся, в основном, только костный материал – рассказывает Игорь Корниенко

В лаборатории идентификации объектов биологического происхождения основной упор делается на разработку методов, позволяющих «искать иголку в стоге сена» - находить и извлекать предельно малое количество ДНК из образцов, находящихся в малопригодном для работы состоянии.  

- Если «свежие» кости богаты ДНК и содержат более 20 000 ДНК-содержащих клеток на 1 кубический миллиметр, которого хватит на десятки исследований, то в древних костных тканях остаются единичные копии ДНК, что существенно затрудняет их анализ. Другая сложность работы в том, что при раскопках может возникнуть контаминация: загрязнение чужой ДНК. К примеру, это может произойти во время раскопок, когда на древний материал могут попасть ДНК современного человека. К примеру, пот или слюна. Так, при проведении реакции по расшифровке генома древнего организма, возникает риск исследования генома современного человека, в данном случае – археолога. Именно поэтому работа с древней ДНК требует особого подхода и тщательной пробоподготовки – начальной стадии очистки ДНК, - рассказывает Игорь Корниенко


 
В 2013 году на базе Академии биологии и биотехнологии ЮФУ была создана лаборатория идентификации объектов биологического происхождения. Сегодня лаборатория оснащена всем необходимым оборудованием,  которое позволяет проводить пробоподготовку древних костей. Сотрудники лаборатории разработали и испытали новый метод выделения ДНК из древнего материала. Этот метод позволяет выделять древнюю ДНК не в классических условиях, требующих особой стерильности, а проводить исследования практически в стандартных лабораторных условиях.   

– Наше исследования оказалось мультидисциплинарным: помимо специалистов в области генетики, судебной медицины и биоинформатики, в работе также задействованы почвоведы, поскольку большую роль для анализа играет то, в какой почве были захоронены останки. Такая комплексная работа в разы повышает качество исследований и анализа древней ДНК.   

Помимо этого, преимущество метода ЮФУ в том, что классический метод выделения фрагмента ДНК с трудом позволит получить более 200 нуклеотидных пар, в то время как метод учёных ЮФУ позволяет выделить фрагменты большего размера и более высокого качества. К примеру, при анализе древних останков мамонта удалось выделить фрагменты ДНК размером более 1500 нуклеотидных пар. Также метод позволяет максимально избавиться от современных ДНК на древнем биологическом материале.   

Разработанный метод получил широкое признание в


- В современной биологии трендом является изучение древней ДНК. За последние 25 лет мы сильно продвинулись в изучении древней ДНК благодаря развитию различных методов исследования. К сожалению, сейчас не все лаборатории имеют возможность работать именно с древней ДНК: сложность заключается в том, что после смерти от человека остаётся, в основном, только костный материал – рассказывает Игорь Корниенко

В лаборатории идентификации объектов биологического происхождения основной упор делается на разработку методов, позволяющих «искать иголку в стоге сена» - находить и извлекать предельно малое количество ДНК из образцов, находящихся в малопригодном для работы состоянии.  

- Если «свежие» кости богаты ДНК и содержат более 20 000 ДНК-содержащих клеток на 1 кубический миллиметр, которого хватит на десятки исследований, то в древних костных тканях остаются единичные копии ДНК, что существенно затрудняет их анализ. Другая сложность работы в том, что при раскопках может возникнуть контаминация: загрязнение чужой ДНК. К примеру, это может произойти во время раскопок, когда на древний материал могут попасть ДНК современного человека. К примеру, пот или слюна. Так, при проведении реакции по расшифровке генома древнего организма, возникает риск исследования генома современного человека, в данном случае – археолога. Именно поэтому работа с древней ДНК требует особого подхода и тщательной пробоподготовки – начальной стадии очистки ДНК, - рассказывает Игорь Корниенко


 
В 2013 году на базе Академии биологии и биотехнологии ЮФУ была создана лаборатория идентификации объектов биологического происхождения. Сегодня лаборатория оснащена всем необходимым оборудованием,  которое позволяет проводить пробоподготовку древних костей. Сотрудники лаборатории разработали и испытали новый метод выделения ДНК из древнего материала. Этот метод позволяет выделять древнюю ДНК не в классических условиях, требующих особой стерильности, а проводить исследования практически в стандартных лабораторных условиях.   

– Наше исследования оказалось мультидисциплинарным: помимо специалистов в области генетики, судебной медицины и биоинформатики, в работе также задействованы почвоведы, поскольку большую роль для анализа играет то, в какой почве были захоронены останки. Такая комплексная работа в разы повышает качество исследований и анализа древней ДНК.   

Помимо этого, преимущество метода ЮФУ в том, что классический метод выделения фрагмента ДНК с трудом позволит получить более 200 нуклеотидных пар, в то время как метод учёных ЮФУ позволяет выделить фрагменты большего размера и более высокого качества. К примеру, при анализе древних останков мамонта удалось выделить фрагменты ДНК размером более 1500 нуклеотидных пар. Также метод позволяет максимально избавиться от современных ДНК на древнем биологическом материале.   

Разработанный метод получил широкое признание в, погибших в ходе боевых операций в Чеченской Республике.
В 2004 г. был назначен старшим группы по ДНК-идентификации заложников, погибших в результате террористического акта 1-3 сентября 2004 г. в городе Беслане. Имеет государственные, правительственные и ведомственные награды из них медаль ордена "За заслуги перед отечеством" II степени (Указ Президента Российской Федерации "О награждении государственными наградами Российской Федерации" N 465 от 09.04.2008 г  


 

Краткая ссылка на новость sfedu.ru/news/56758