Размер шрифта

A
A

Межстрочный интервал

A
A

Цвет

A
A
26 августа 2019 г.

Магистрант ЮФУ принял участие в Школе по системной биологии в Дрездене

26 августа 2019 г.

С 10 по 17 августа в Дрездене проходила школа по системной биологии. Организаторами выступили Центр системной биологии и Институт молекулярной клеточной биологии и генетики (MPI-CBG) сообщества Макса Планка, а также Дрезденский технический университет.

 

Участниками стали 15 человек из 10 разных стран (США, Индия, Китай и страны Европы) и 3 ступеней образования: бакалавриат, магистратура, аспирантура (PhD). Кроме того, для такого междисциплинарного направления требовалось и разнообразие в направлениях подготовки участников, поэтому среди них в итоге оказались биоинформатики, математики, биоинженеры, физики и биологи. Одним из участников стал магистрант физического факультета Южного федерального университета (ЮФУ) и сотрудник НИТЦ Нейротехнологий ЮФУ Саевский Антон.

В этот раз школа проводилась в обновленном формате и была сфокусирована на получении участниками практических навыков в области системной биологии. Было сформировано 4 группы с прикрепленным наставником для выполнения отдельных проектов о биологических системах различных уровней: от транскриптомного до организменного. Группы также формировались по принципу разнообразия и междисциплинарности, так чтобы каждый участник мог внести свой уникальный вклад в проект и получить максимальное количество новых знаний. В ходе выполнения проектов были затронуты 5 крупных вычислительных направлений: машинное обучение и компьютерное зрение, численные симуляции и высокопроизводительные вычисления, стохастические и статистические методы, теория сетей и самоорганизация, молекулярное моделирование и эволюционная динамика.

Помимо богатого практического опыта в самых передовых научных областях, участники также черпали знания из вечерних интерактивных презентаций ведущих ученых различных биологических направлений, после чего с ними же отправлялись на ужин для продолжения дискуссий уже в менее формальном ключе.

Участнику из ЮФУ достался проект о формировании передне-задней оси эмбриона на примере модельного организма Caenorhabditis elegans. Коллегами по проекту оказались биоинженер из Сербии, физик из Германии и математик из Люксембурга. Выполнение проекта состояло из 3 основных частей: анализ стабильности дифференциальных уравнений модели, численные симуляции при различных параметрах и обработка последовательностей изображений для извлечения реальных данных и объединения их с моделью.

Каждый вечер группы собирались в конференц-зале, представляя промежуточные результаты. В целом все группы успешно справились со своей работой, что в конце школы отметил один из организаторов Иво Збалзарини, который также остался доволен в целом набором участников в этом году, сформировавшими такую творческую и живую атмосферу, на которую и рассчитывали организаторы.

Помимо научной работы, участники также имели возможность отдохнуть и пообщаться, наслаждаясь поездкой по Эльбе на теплоходе, а затем и пешей экскурсией по городу и визитом в Дрезденский музей гигиены. За время школы участники приобрели уникальный научный опыт, а также тесно познакомились как во время тесной работы, так и во время неформальных мероприятий. Так что цели школы по развитию международной сети ученых и привлечению студентов для обучения в MPI-CBG можно считать достигнутыми.

Краткая ссылка на новость sfedu.ru/news/61318