НОЦ системных технологий проектирования ЮФУ создан на базе Научно-конструкторского бюро вычислительных систем Южного федерального университета (НКБ ВС ЮФУ), которое приказом ректора в декабре 2007 года переименовано в Научно-образовательный центр системных технологий проектирования ЮФУ.
В настоящее время в НОЦ системных технологий проектирования ЮФУ создается ряд учебных лабораторий для подготовки магистров по специализации "Базовые системные технологии проектирования интеллектуальных систем управления и радиоэлектронных комплексов".
Основная цель деятельности научно-образовательного центра - поиск, апробация и внедрение новых методов, механизмов и форм решения приоритетной задачи развития ЮФУ по совместной модернизации научно-исследовательского и образовательного процессов в соответствии с принципами интеграции науки и высшего образования, направленной на создание условий качественной, конкурентоспособной и востребованной рынком труда профессиональной подготовки по приоритетным направлениям развития науки и техники в области интеллектуальных систем управления, автоматики, телемеханики и радиотехники, информационных, телекоммуникационных и суперкомпьютерных технологий.
Вдохновитель и создатель НОЦа - директор ОАО "Научно-конструкторское бюро вычислительных систем" Игорь Итенберг.