За период с 23 марта по 30 июня 2009 года в Роснауке были проведены открытые конкурсы на право заключения государственных контрактов по мероприятию 1.1 «Проведение научных исследований коллективами научно-образовательных центров» (I и II очереди – «Технические науки», III очередь – Научные исследования, проводимые в интересах развития высокотехнологичных секторов экономики, IV и V очереди – «Естественные науки», VI очередь – «Гуманитарные науки») ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 годы.

В конкурсе приняли участие представители всех федеральных округов Российской Федерации: 929 заявок, допущенных к конкурсу по шести очередям, были поданы от ЦФО (46,4%). По остальным округам допущенные к конкурсу заявки распределились следующим образом: СФО – 295 (14,7%), ПФО – 262 (13,1%), СЗФО – 200 (10,0%), ЮФО – 137 (6,8%), УФО – 110 (5,5%), ДВФО – 68 (3,4%).

По результатам конкурса будет заключено 382 государственных контракта на общую сумму около 4,7 млрд. рублей.

Уровень конкуренции заявок был достаточно высоким и составил в среднем по всем 1:6. Наиболее востребованными оказались проекты по техническим и гуманитарным наукам, средний конкурс по которым, соответственно, составлял 7,8 и 6,5 заявок на проект. По отдельным областям знаний («Обработка, хранение, передача и защита информации», «Создание интеллектуальных систем навигации и управления») конкурс доходил до 15-16 заявок на проект, по лоту «Нанотехнологии и наноматериалы» было подано 164 заявки на 18 проектов.

Организации-лидеры по числу поданных заявок: Томский государственный университет (40 заявок), Томский политехнический университет (34 заявки), Московский государственный технический университет имени Н.Э. Баумана (32 заявки), Московский инженерно-физический институт (государственный университет) (30 заявок), Южный федеральный университет (28 заявок), Российский университет дружбы народов (27 заявок), Государственный технологический университет Московский институт стали и сплавов (26 заявок).

Лидерами по числу победивших заявок по итогам конкурсов стали Томский государственный университет, Московский инженерно-физический институт (государственный университет) - 8 заявок выиграли в конкурсе, Южный федеральный университет - 7 заявок выиграли в конкурсе.

НОЦы Южного федерального университета – победители федерального конкурса:

1. НОЦ «Многопроцессорные вычислительные и управляющие системы» (Госконтракт 15 мл. руб., руководитель И.А. Каляев)
2. НОЦ «Инноватика» (Госконтракт 6 мл .руб., руководитель А.А.Золотарев)
3. НОЦ «Микросистемная техника и мультисенсорные мониторинговые системы» (Госконтракт 15 мл. руб., руководитель А. Н.Королев)
4. НОЦ «Глобальных и региональных географо-экологических исследований и инновационных технологий» (Госконтракт 10 мл. руб., руководитель Ю. А.Федоров)
5. НОЦ «Магнетохимия координационных соединений» (Госконтракт 15 мл. руб., В.В.Луков)
6. НОЦ «Информационные технологии» (Госконтракт 12 мл. руб., Б.Я.Штейнберг)
7. НОЦ «Системный анализ и моделирование социальных процессов Юга России» (Госконтракт 13.5 мл. руб., М.Д. Розин)